報運貨物進、出口可能發生之費用除下列數種外，另可參閱本網站「海關徵收規費規則及特別監視費、押運費之徵收標準、繳費義務人及核准文件表(本規則第四、七條附表)」：
科技產業園區(又稱加工出口區)、科學工業園區與經政府核准設置之經貿營運特區等區內事業、保稅工廠及物流中心，將貨物樣品送區(廠、中心）外檢驗、測試者，免徵特別驗貨費。
- 進出口貨物經海關核准在下列情形下查驗者，應徵收特別驗貨費，每一報單新臺幣一千三百元。
- 海關核准登記之倉庫、貨櫃集散站、航空貨物集散站及卸貨之碼頭空地以外地方存放貨物之查驗。
- 經貨主請求對進出口貨物之複驗或特別查驗。
- 船(機)邊放行進出口貨物之查驗。
- 因貨主或報關人之疏誤，須由海關作第二次派單之查驗。
- 辦公時間外之查驗貨物。
同一貨主同時申報一份以上之進口報單或出口報單，如係同一種貨物並在同一時間及地點查驗者，按一份報單徵收特別驗貨費。
- 經海關派員監視辦理事項，按下列規定徵收特別監視費。但經海關核准實施自主管理之事項，免徵特別監視費。
- 每一船(機)徵收特別監視費每一班新臺幣二千元。
- 每一貨櫃集散站、航空貨物集散站、進出口貨棧、保稅倉庫徵收特別監視費每一班新臺幣一千元。
- 每一保稅運貨工具及其餘應徵特別監視費每一班新臺幣四百五十元。
前項特別監視費所稱每一班，係以一日分為日勤(自上午六時至下午六時)、夜勤(自下午六時至次日上午六時)二班計算，不滿一班時限者，仍按一班計徵。
第一項應徵特別監視費之貨物，因法院為關務案件辦理假扣押者，其扣押期間免徵特別監視費。
第一項之服務項目、徵收標準及繳費義務人依附表一規定辦理。
- 經海關派員押運事項，按下列規定徵收押運費：
- 同一關區貨櫃（物）之押運，徵收押運費新臺幣六百元。
- 不同關區貨櫃（物）之押運，按押運距離徵收押運費。
前項所稱押運距離係指押運起運地至目的地之車行最短距離。
第一項貨物之押運，應以車程一趟為一次計徵，且不得超過三部拖車或其他車輛。但海關因監管需要分階段二次以上押運者，按一次計徵；如目的地分屬不同關區並分次徵收押運費者，其第二次押運應徵之押運費，則以扣除第一次徵收之押運費金額後之差額徵收。
同一繳費義務人同時申報一份以上進口或出口報單，且係同一種貨物，並裝入同一個貨櫃，按一次徵收押運費。
第一項之服務項目、徵收標準及繳費義務人依附表二規定辦理。
- 在實施貨物通關自動化通關作業之關稅局，未連線業者所遞送之書面報單、艙單或其他報關文件由海關代為輸入電腦者，依下列規定徵收報關文件鍵輸費。但旅客不隨身行李自行報關遞送之書面報單，由海關代為輸入電腦者，免徵報關文件鍵輸費。
- 報單：每份徵收新臺幣二百元。
- 艙單：每份按頁徵收新臺幣二百元，不滿一頁者仍以一頁計徵。
- 經海關指定公告之其他報關文件：每份徵收新臺幣一百元。
在實施貨物通關自動化通關作業之關稅局，連線業者除具有正當理由經海關核准者外，其所遞送前項規定書面文件需由海關代為輸入電腦者，準用前項規定徵收鍵輸費。
前二項徵收鍵輸費之報關文件項目、關稅局名稱及起徵日期，應由財政部關稅總局視貨物通關自動化實施程度事先公告之。
- 下列進出口貨物免徵特別驗貨費、特別監視費及押運費：
- 旅客行李。
- 軍事機關進出口貨物。
- 加工出口區出口郵包。
- 緊急救難或防疫之器材、物品及救濟物資。
- 文件、雜誌、刊物及報紙其毛重在二十公斤以下者。
- 下列進出口貨物減半徵收特別驗貨費、特別監視費及押運費。
- 進口貨物、郵包、貨物樣品及餽贈自用物品，其完稅價格不超過美金五千元者。
- 出口貨物、郵包、貨物樣品及餽贈物品，其離岸價格不超過美金五千元者。
- 海關因人民申請核發下列文件，應徵收簽證文件費每份新臺幣一百元：
- 進口報單進口證明用聯、沖退原料稅用聯及其他用途聯。
- 出口報單沖退原料稅用聯、退內地稅用聯、出口證明用聯及其他用途聯。
- 貨主為申請修改或補發輸出(入)許可證或其他文件，需要海關簽證者。
- 電腦資料文件、海關單證或稅款收據之抄本或影本。
申請補發前項第一款至第三款證明文件，或助航服務費繳納證副本者，依前項規定徵收簽證文件費。但尚未繳款之稅費繳納證申請補發者免徵。